Ярославль считается абсолютно уникальным городом с огромным числом памятников архитектуры и истории. Среди них большое количество церквей и храмовых ансамблей, к числу которых относят комплекс Казанского женского монастыря. Посещение этого храма станет весьма впечатляющим и познавательным событием.
История создания храма тесно связана с появлением в Ярославле чудотворной иконы Казанской Богоматери. С этим православным образом связано множество необъяснимых событий. По неизвестным причинам в 1588 году икону доставили из Казани в г. Тутаев (Романов). Легенда гласит, что служителю Герасиму Трифонову явился образ Божией Матери, велевшей возвести в городе Романове церковь, купив икону в одной из торговых лавок Казани. Вскоре чудотворная икона Богоматери помогла местным жителям исцелиться от многих недугов, да и сам Герасим Трифонов смог вылечить свою больную руку. Во времена Смуты польскому поручику Якову Любскому удалось вывезти икону за пределы Романова, а в последствии продать в руки ярославского купца Василия Лыткина.
В период осады Ярославля 1609 года одному из священнослужителей привиделся образ Богоматери, повелевавший возвести церковь, посвященную ее Казанскому образу. Диакон Елизар видел такое же повеление. Спустя 24 дня осада Ярославля была снята, польские войска отступили, а спасенные жители начали строительство храма, в который и поместили чудотворный образ. Спустя время население Романова огласило требование о возвращении святыни в родной город, но по велению царя ценную икону оставили в Ярославле.
Каменный храм, возведенный в 1649 году, был оснащен трапезной, колокольней и прочими вспомогательными постройками. Отдельные кельи и ограждения по-прежнему оставались деревянными. Многие здания храмового комплекса были разрушены пожаром 1658 года. С 1770 года начался длительный период реставрации церковных построек, которые приходилось отстраивать практически с нуля.
К своему 300-летнему юбилею церковный ансамбль переживал яркий период расцвета. Около четырехсот сестер-прихожанок нашли свой дом в стенах монастыря, сотни гостей приезжали сюда ежегодно. Именно поэтому храм удостоился особого расположения княгини Елизаветы Федоровны. Комплекс славился своими ремеслами, иконописью, выпечкой и славным церковным хором.
Начало ХХ века стало периодом глобальных перемен. В 1918 году произошло народное антибольшевистское восстание, сопровождаемое артобстрелами. В результате массовых беспорядков здание получило значительные повреждения, приход был закрыт, а вся церковная утварь вывезена. В 1919 году здесь организовали один из концентрационных лагерей, а в 1928 году тут расположился государственный архив Ярославских земель. После 1930 года в зданиях комплекса открывали библиотеку, планетарий и молодежный центр.
Во время всех перестроек и переделок удивительная чудотворная икона и другие святыни монастыря бесследно исчезли. До сегодняшнего для никаких подробностей случившегося неизвестно.
В 1990 году начались работы по реставрации храмового ансамбля, а к 1998 году все ремонтные мероприятия уже завершились. В монастыре разместили копию чудотворного образа Богоматери, восстановили некоторые корпуса, Сретенский храм, Покровский и Казанский собор. С 2000 года здесь находится часть мощей святого Митрополита Агафангела. Первый крестный ход с чудотворным образом прошел 2 июля 2002 года. Новый образ Богоматери уже исцелил множество недугов и болезней, известны даже достаточно тяжелые случаи, которых удалось избежать.